Orgue en ville est administré par une association loi 1901.

• Pierre-Yves Fleury conseiller artistique et trésorier, organiste diplômé du CNSMD de Lyon, concertiste, professeur au Conservatoire à Rayonnement Régional de Besançon
• Pauline Chabauty présidente et chargée de la communication au sein de l’association, professeur de mathématiques
• Claude Montigné secrétaire de l’association, Présidente du conseil consultatif d’habitants du quartier de Montrapon, organiste, retraitée
• Rodolphe Dumoulin vice-président
• Michel Mathey retraité
• Guilaine Mulin professeur de français
• Arnaud Carpentier professeur de musique